Virus Nucleic Acid Detection

ဗိုင်းရပ်စ်အများစု၏ မျိုးရိုးဗီဇ အမျိုးအစားများကို သိရှိပြီးဖြစ်သည်။ဖြည့်စွက်ဗိုင်းရပ်စ် DNA သို့မဟုတ် RNA အပိုင်းများနှင့် ပေါင်းစပ်ရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသော DNA ၏ တိုတောင်းသော အပိုင်းများဖြစ်သည့် Nucleic acid probes များ။Polymerase ကွင်းဆက်တုံ့ပြန်မှု (PCR) သည် ဗိုင်းရပ်စ်ရှာဖွေခြင်းအတွက် ပိုမိုထိရောက်သောနည်းပညာတစ်ခုဖြစ်သည်။မြင့်မားသောရောဂါရှာဖွေရေးနည်းလမ်းများကို မကြာသေးမီက တီထွင်ခဲ့သည်။

A. Nucleic acid hybridization နည်းပညာ

တောင်ပိုင်း blotting (တောင်ပိုင်း) နှင့် Northern blotting (မြောက်ပိုင်း) အပါအဝင် အဓိကအားဖြင့် Nucleic acid ပေါင်းစပ်ဖွဲ့စည်းခြင်းသည် ဗိုင်းရပ်စ်ရောဂါရှာဖွေရေးနယ်ပယ်တွင် လျင်မြန်စွာတိုးတက်နေသော နည်းပညာအသစ်တစ်ခုဖြစ်သည်။မျိုးစပ်ခြင်းဆိုင်ရာ ဆန်းစစ်ချက်၏ ကျိုးကြောင်းဆီလျော်မှုသည် ဖြည့်စွက်ဗိုင်းရပ်စ် DNA သို့မဟုတ် RNA အပိုင်းများနှင့် ပေါင်းစပ်ရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည့် DNA တိုတောင်းသော အပိုင်းများကို အသုံးပြုရန်ဖြစ်သည်။အပူပေးခြင်း သို့မဟုတ် အယ်ကာလိုင်း ကုသခြင်းဖြင့်၊ နှစ်ထပ်သော ပစ်မှတ် DNA သို့မဟုတ် RNA ကို ကြိုးတန်းတစ်ခုတည်းအဖြစ် ခွဲထုတ်ပြီးနောက် အစိုင်အခဲ ပံ့ပိုးမှုတစ်ခုတွင် ရွှေ့ပြောင်းထားသည်။ယင်းနောက်၊ စူးစမ်းလေ့လာမှုကို ပစ်မှတ် DNA သို့မဟုတ် RNA နှင့် ပေါင်းစပ်ထည့်သွင်းထားသည်။စုံစမ်းစစ်ဆေးမှုအား အိုင်ဆိုတုပ် သို့မဟုတ် ရေဒီယိုသတ္တိကြွမဟုတ်သော နူကလစ်ဖြင့် တံဆိပ်တပ်ထားသောကြောင့် ပစ်မှတ် DNA သို့မဟုတ် RNA ကို autoradiography သို့မဟုတ် biotin-avidin စနစ်ဖြင့် ရှာဖွေတွေ့ရှိနိုင်သည်။ဗိုင်းရပ်စ်မျိုးရိုးဗီဇအများစုကို ပုံတူပွားပြီး စီတန်းထားသောကြောင့်၊ ၎င်းတို့ကို နမူနာရှိ စူးစမ်းလေ့လာမှုအဖြစ် ဗိုင်းရပ်စ်-သတ်သတ်မှတ်မှတ် အစီအမံများကို အသုံးပြု၍ ရှာဖွေတွေ့ရှိနိုင်သည်။လက်ရှိတွင် မျိုးစပ်ခြင်းနည်းလမ်းများတွင် အစက်အပြောက်၊ in situ hybridization ဆဲလ်များ၊ DNA blotting (DNA) (Southern blot) နှင့် RNA blotting (RNA) (Northern blot) တို့ ပါဝင်သည်။

B.PCR နည်းပညာ

မကြာသေးမီနှစ်များအတွင်း၊ in vitro nucleic acid amplification techniques များကို PCR ပေါ်တွင်အခြေခံ၍ အာရုံမခံစားနိုင်သော သို့မဟုတ် မွေးမြူမရနိုင်သောဗိုင်းရပ်စ်များကို စမ်းသပ်ရန်အတွက် စီးရီးများကို တီထွင်ခဲ့သည်။PCR သည် in vitro polymerase တုံ့ပြန်မှုဖြင့် တိကျသော DNA sequence ကို ပေါင်းစပ်နိုင်သော နည်းလမ်းတစ်ခုဖြစ်သည်။PCR လုပ်ငန်းစဉ်တွင် အဆင့်သုံးဆင့်ဖြစ်သော အပူစက်ဝန်းတစ်ခုပါဝင်သည်- denaturation၊ annealing နှင့် extension သည် မြင့်မားသောအပူချိန် (93℃~95℃)တွင် ကြိုးနှစ်ထပ် DNA ကို တစ်ခုတည်း DNA ကြိုးနှစ်ခုအဖြစ် ပိုင်းခြားထားသည်။ထို့နောက် အပူချိန်နိမ့်သော (37 ℃ ~ 60 ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်) ပေါင်းစပ်ထားသော DNA အပိုင်းများသို့ ပေါင်းစပ်ထားသော nucleotide primers နှစ်ခုကို ချန်လှပ်ထားသည်။Taq အင်ဇိုင်း (72 ℃) အတွက် သင့်လျော်သော အပူချိန်တွင် ဖြစ်သော်လည်း၊ DNA ကွင်းဆက်အသစ်များ ပေါင်းစပ်မှုကို ပရိုမာ 3'end မှ အစပြု၍ ဖော်စပ်ထားသော DNA ကို နမူနာပုံစံများနှင့် တစ်ခုတည်းသော nucleotides များအဖြစ် ပစ္စည်းများအဖြစ် အသုံးပြုထားသည်။ထို့ကြောင့် သံသရာတစ်ခုစီပြီးနောက်၊ DNA ကွင်းဆက်တစ်ခုအား ကွင်းဆက်နှစ်ခုအဖြစ် ချဲ့နိုင်သည်။ဤလုပ်ငန်းစဉ်ကို ထပ်ခါတလဲလဲလုပ်ခြင်း၊ သံသရာတစ်ခုတွင် ပေါင်းစပ်ထုတ်လုပ်ထားသော DNA ကွင်းဆက်တစ်ခုစီကို နောက်သံသရာတွင် ပုံစံပလိတ်အဖြစ် အသုံးပြုနိုင်ပြီး၊ သံသရာတစ်ခုစီတွင် DNA ကွင်းဆက်များ၏ အရေအတွက်သည် နှစ်ဆတိုးသွားသည်၊ ဆိုလိုသည်မှာ PCR ထုတ်လုပ်မှုကို 2n မှတ်တမ်းအမြန်နှုန်းဖြင့် ချဲ့ထွင်ပါသည်။25 မှ 30 ပတ်ကြာပြီးနောက် PCR ထုတ်လုပ်မှုကို electrophoresis ဖြင့်ဖော်ထုတ်ပြီး သီးခြား DNA ထုတ်ကုန်များကို ခရမ်းလွန်ရောင်ခြည် (254nm) အောက်တွင် ကြည့်ရှုနိုင်သည်။၎င်း၏အားသာချက်၊ အာရုံခံနိုင်စွမ်းနှင့် အဆင်ပြေစေရန်အတွက် HCV၊ HIV၊ CMV နှင့် HPV ကဲ့သို့သော ဗိုင်းရပ်စ်ကူးစက်မှုများစွာကို လက်တွေ့စမ်းသပ်စစ်ဆေးရာတွင် PCR ကို လက်ခံကျင့်သုံးခဲ့သည်။PCR သည် အလွန်အကဲဆတ်သောကြောင့်၊ ၎င်းသည် fg အဆင့်တွင် ဗိုင်းရပ်စ် DNA ကိုရှာဖွေနိုင်သည်၊ မှားယွင်းသောအပြုသဘောကိုရှောင်ရှားရန် ခွဲစိတ်မှုကို ဂရုတစိုက်လုပ်ဆောင်သင့်သည်။ထို့အပြင်၊ nucleic acid စမ်းသပ်မှုတွင် အပြုသဘောဆောင်သော ရလဒ်သည် နမူနာတွင် တိုက်ရိုက်ကူးစက်နိုင်သော ဗိုင်းရပ်စ်ရှိနေသည်ဟု မဆိုလိုပါ။

PCR နည်းစနစ်ကို ကျယ်ပြန့်စွာ အသုံးချခြင်းဖြင့်၊ မတူညီသော စမ်းသပ်မှုရည်ရွယ်ချက်အတွက် PCR နည်းစနစ်ကို အခြေခံ၍ နည်းစနစ်အသစ်နှင့် နည်းလမ်းများကို တီထွင်ကြသည်။ဥပမာအားဖြင့်၊ real time quantitative PCR သည် viral load ကို detect လုပ်နိုင်သည်၊PCR သည် တစ်သျှူး သို့မဟုတ် ဆဲလ်များတွင် ဗိုင်းရပ်စ်ကူးစက်မှုကို ဖော်ထုတ်ရန် အသုံးပြုသည်။nested PCR သည် PCR ၏တိကျမှုကိုတိုးစေနိုင်သည်။၎င်းတို့အနက်၊ အချိန်နှင့်တပြေးညီ ပမာဏ PCR သည် ပိုမိုလျင်မြန်စွာ တီထွင်နိုင်ခဲ့သည်။TaqMan hydrolysis probe၊ hybridization probe နှင့် molecular beacon probe ကဲ့သို့သော နည်းပညာအသစ်များစွာကို လက်တွေ့သုတေသနတွင် တွင်ကျယ်စွာအသုံးပြုနေသည့် အချိန်နှင့်တပြေးညီ quantitative PCR နည်းပညာအဖြစ် ပေါင်းစပ်ထားသည်။လူနာများ၏ ခန္ဓာကိုယ်အရည်များအတွင်း ဗိုင်းရပ်စ်ပိုးဝင်ခြင်းကို တိကျစွာသိရှိနိုင်သည့်အပြင် ဆေးဝါးခံနိုင်ရည်ရှိသော မျိုးပြောင်းမှုကိုလည်း ရှာဖွေဖော်ထုတ်ရန် ဤနည်းလမ်းကို အသုံးပြုနိုင်သည်။ထို့ကြောင့်၊ အချိန်နှင့်တပြေးညီ ပမာဏ PCR ကို ကုသရေးအကျိုးသက်ရောက်မှုကို အကဲဖြတ်ခြင်းနှင့် ဆေးဝါးသည်းခံနိုင်မှု စောင့်ကြည့်ခြင်းတွင် အဓိကအားဖြင့် အသုံးချပါသည်။

C. ဗိုင်းရပ်စ် နျူကလိစ်အက်ဆစ်များကို မြင့်မားသော ဖောက်ထုတ်မှုကို ထောက်လှမ်းခြင်း။

ပေါ်ပေါက်လာသော ကူးစက်ရောဂါအသစ်များ၏ လျင်မြန်သောရောဂါရှာဖွေဖော်ထုတ်ခြင်းအတွက် လိုအပ်ချက်များကို ဖြည့်ဆည်းပေးရန် DNA ချစ်ပ်များ (DNA) ကဲ့သို့သော မြင့်မားသော ဖောက်ပြန်ထောက်လှမ်းမှုနည်းလမ်းများကို တည်ထောင်ထားသည်။DNA ချစ်ပ်များအတွက်၊ တိကျသော probes များကို ပေါင်းစပ်ထားသော DNA probe microarray (DNA) ကို ဖန်တီးရန်အတွက် အလွန်မြင့်မားသော သိပ်သည်းဆတွင် ဆီလီကွန် ချစ်ပ်ငယ်များနှင့် ချိတ်ဆက်ထားပါသည်။ပေါင်းစပ်ဖွဲ့စည်းမှု၏ signal ကို confocal microscope သို့မဟုတ် လေဆာစကင်နာဖြင့် ပုံဖော်နိုင်ပြီး ကွန်ပျူတာဖြင့် ဆက်လက်လုပ်ဆောင်နိုင်ပြီး မတူညီသောမျိုးဗီဇများနှင့်ပတ်သက်သော ကြီးမားသောဒေတာအစုံကို ရယူနိုင်ပါသည်။DNA ချစ်ပ် နှစ်မျိုးရှိသည်။"ပေါင်းစပ်ချစ်ပ်" သည် အောက်ပါအတိုင်းဖြစ်သည်- သီးခြား oligonucleotides များကို ချစ်ပ်များပေါ်တွင် တိုက်ရိုက် ပေါင်းစပ်ထားသည်။နောက်တစ်ခုကတော့ DNA pool chip ပါ။မျိုးပွားဗီဇများ သို့မဟုတ် PCR ထုတ်ကုန်များကို ဆလိုက်ပေါ်တွင် စနစ်တကျ ရိုက်နှိပ်ထားသည်။DNA ချစ်ပ်နည်းပညာ၏ အားသာချက်မှာ DNA အမြောက်အမြားကို တစ်ပြိုင်နက်တည်း ရှာဖွေခြင်းဖြစ်ပါသည်။ရောဂါပိုး ထောက်လှမ်းခြင်း ချစ်ပ်၏ နောက်ဆုံးဗားရှင်းသည် လူသားဗိုင်းရပ်စ် 1700 ကျော်ကို တစ်ပြိုင်နက် ဖော်ထုတ်နိုင်သည်။DNA ချစ်ပ်နည်းပညာသည် သမားရိုးကျ နျူကလိစ်အက်ဆစ် ပေါင်းစပ်ခြင်းနည်းလမ်းများ၏ ပြဿနာများကို ဖြေရှင်းပေးခဲ့ပြီး ဗိုင်းရပ်စ်ရောဂါရှာဖွေခြင်းနှင့် ကူးစက်ရောဂါဆိုင်ရာလေ့လာမှုများတွင် အလွန်ကျယ်ပြန့်သောအသုံးချမှုများပါရှိသည်။


စာတိုက်အချိန်- ဒီဇင်ဘာ-၂၃-၂၀၂၀